对初诊病人，在收费处存入一笔现金（金额凭病人意愿，最低只需挂号费和诊疗费，但足够的暂存款可以免除一次次补交款的麻烦），操作员为之建立个人帐户，发给就诊卡（可选条码卡、磁卡或IC卡，推荐采用磁卡）和门诊病历。

病人凭一卡（就诊卡）一册（门诊病历）即可到诊室找医生看诊（大诊室由诊室导诊台统一排号或建设专业排队叫号系统，按秩序就诊）。

医生就诊时，先将病人就诊卡在阅读器上划卡，系统自动完成挂号费入帐并调取病人的电子病历。医生可以调取自己的主诉模板和病历记录模板，并加以修改，在电脑上填写主诉与病历、检查治疗等（操作有困难时仍暂时用笔记录在门诊病历上）。医嘱直接在工作站上完成，医嘱有辅助检查和用药医嘱两类。

病人作辅助检查时，可凭卡直接到检查科室作检查，检查科室通过划卡给予确认，并可将检查结果回填到检查报告中，医生可在工作站中直接查看检查结果。

当病人有用药医嘱（处方）时，可凭卡直接到门诊西药房和门诊中药房取药。药剂员通过划卡完成打印处方和发药。当有不正确处方时，药房窗口工作站与开方医生工作站之间建立一种纠错机制，无需病人来回跑路。

病人完成门诊后，可以选择到存款结帐处结帐，退回余款，打印门诊费用收据；也可将余款留在帐户上，下次继续使用，只打印门诊费用收据；甚到可以暂不结帐，几次门诊后一起结帐。

病人就诊的过程中出现余款不足时，系统会给出提示信息，提醒病人到收费处补交暂存款。

病人就诊的全部帐目，可以凭卡在门诊大厅设置的自助检查台自行划查询。

门诊的主要统计数字（如门诊量、分项统计、工作量统计等）由系统自动进行统计处理，提供给有关科室查询。

医疗保险病人就诊时，持医保卡到收费处办理就诊卡权限转移手续，暂存一笔现金（用于支持挂号费、自费药品和检查项目、超过个人帐户外的自付、特殊病种按比例自付部分），然后持医院就诊卡到各诊室直接就诊，就诊完成后到收费处办理结帐手续，财务数据和医疗数据传送至医保中心，并作就诊卡权限转移、更新医保就诊卡数据。

病人需要住院医疗时，由医生在处理意见中选择收住病区，系统将自动做好档案转移手续。